Toda la prefectura

Natto, tofu, tofu frito, plantas silvestres comestibles, Imogara (hecho de tallos secos de patatas Karatori), konjac, setas, cebollas, perejil japonés, miso

En la prefectura de Yamagata, era habitual que la gente hiciera natto (soja fermentada) en casa como forma de conservar los alimentos para pasar el invierno, cuando escasean. El natto se hacía metiendo la soja hervida en un tubo hecho de paja y colocándolo en un lugar cálido, como junto al kotatsu (mesa de calentamiento cubierta con una manta), durante una o dos noches. En la zona de Murayama, en la ciudad de Oe, la soja fermentada sin hilos se convierte en "Natto Jiru" (sopa de natto). "Natto Jiru" es un plato casero de invierno que ha sido popular en la prefectura de Yamagata durante mucho tiempo. El natto se muele en un mortero hasta que se vuelve completamente cremoso, luego se espesa y se mezcla en la sopa. La "Imogara", hecha de tallos secos de patatas Karatori, es un ingrediente indispensable en el "Natto Jiru". Se trata de una valiosa fuente de proteínas con mucho tofu y tofu frito, junto con productos secos y salados y otras conservas. Se come el día de Nanakusa (7 de enero) en la zona de Murayama, el día de Año Nuevo en la zona de Mogami, y en la zona de Shonai, a veces se come el "Daikoku-sama no Otoshiya (Año Nuevo del Dios de la Riqueza)" (9 de diciembre).

La sopa de natto se elabora con natto (soja fermentada), que espesa la sopa y evita que se enfríe, y se consume como sopa calentadora en los inviernos fríos.
En las regiones con mucha nieve, no es posible preparar las siete hierbas a principios de la primavera, por lo que se acostumbra a tomar sopa de natto hecha con alimentos secos y conservados durante la temporada de las siete hierbas para rezar por la buena salud y la buena fortuna durante todo el año. En la zona de Mogami, se come el día de Año Nuevo y el 3 de enero. En la zona de Shonai, se come el 9 de diciembre, la noche en que Daikoku-sama recibe a su esposa, o en Nochevieja. En el "Daikoku-sama no Otsu-ya" se ofrecen alubias fritas, arroz frito y "makka daikon" (rábano con dos mitades), y se preparan platos con alubias y daikon para celebrar una cosecha abundante y la prosperidad de la descendencia.

El grado de tosquedad del natto machacado varía de una casa a otra, pero a menudo se machaca con tanto cuidado que a primera vista no hay natto en él. Al machacar, el natto se absorbe fácilmente en la sopa y se vuelve suave al paladar. La clave para cocinar el natto es machacar cada alubia por separado, ya que si se remueve demasiado, se vuelve pegajosa y resbaladiza, lo que dificulta su trituración.
El secreto de la cocción del natto es triturar las judías una a una. Al añadir el natto machacado, combínelo con el miso en un mortero y añádalo después de extenderlo en la sopa para que sea más fácil de mezclar. Una vez añadidos el miso y el natto, es mejor no cocinarlos demasiado.

Últimamente, es menos común que se prepare en casa debido al tiempo y el esfuerzo que requiere, pero todavía se sirve en posadas, restaurantes y como elemento del menú de los almuerzos escolares. La sopa de natto es uno de los platos más populares de los menús escolares.
Para que la sopa de natto sea fácil de preparar en casa, se ha comercializado como "set de sopa de natto (caldo de sopa de natto)" y se vende en los supermercados.